La obra completa es la denominada copia 2ª y su estructura es:

Carpeta 1: ARAÚJO, 1º (I), 2ª copia pp. 1 - 500.
Carpeta 2: ARAÚJO, 2º (I), 2ª copia pp. 501 - 1000 (se repite la p. 930; las pp. 642 y 643 están numeradas como 442 y 443).
Carpeta 3: ARAÚJO, 3º (I), 2ª copia pp. 1001 - 1657.
Carpeta 4: ARAÚJO, 4º (I), 2ª copia pp. 1501 - 1789 ( como se ve hay repetición de los 1501 al 1657). Hemos de advertir que no todo el texto está sometido a correcciones; sólo las pp. de la carpeta 1 están con correcciones.

• Incipit prologus in Legenda beati Fratris Venturini, Ordinis Praedicatorum, (3 ff. pp 1-6)

• De origine Mali (ff. 7-8)

• Un folio escrito a lápiz, sobre los teólogos de Trento. Cita: Fr. Bartolomé Carranza, Felici Castel Franco ¿autor o escritor?, Diego de San Pedro, Alfonso de Palma hispano, Gabriel de Guzmán, Fr. Pedro de Soto. (f. 9).

• Dos ff. de contabilidad: Cuenta de Roma, de la Provincia de España, Madrid, 25/09/1930, firma el P. Fr. José María Solís (hoy beato) y un pliego que debe ser de la contabilidad de la Rev. Analecta S.O.P. que dirigía el P. Fr. Canal, Roma 12/07/1932, entrate y uscite y restano. (ff. 10-11)

• Tres ff., sueltos, escritos a lápiz y 16 billetitos dedicados a teólogos españoles: Fr. Pedro de Soto, Alonso de Herrera y Carranza. Los billetitos se refieren principalmente a bibliografía, aunque hay algunas pequeñas anotaciones: Cano, Pedro de Soto, Pedro de León, Gabriel Guzmán, Domingo de Soto... (ff. 12-14); el sobre con los billetitos lleva el n. 15, como si fuera un folio)

• Copia de una carta de Felipe II al embajador Vargas, sobre Fr. Pedro de Soto, Madrid, 05/08/1562 ( Original en archivo de Simancas, Estado, leg. 332. Que no vaya Fr. Pedro de Soto al concilio de Trento. Son 4 cuartillas, escritas por una cara y están, originalmente numeradas del 1 al 4 (sobre como folio 16)

Es la transcripción de la obra de la Metafísica de Aristóteles, para su publicación en nuestros días.

Apuntes, más bien notas, sobre metafísica y lógica. Todos los temas están incompletos, es decir, los folios o cuartillas dependerían de textos más amplios que no ha llegado a nosotros.

La obra completa es la denominada copia 2ª y su estructura es: en la primera carpeta, pp. 1 -500; en la segunda, pp 501 - 1000; en la tercera pp. 1001 - 1657 y en la cuarta, pp. 1501 -1789 (están repetidas las pp. 1501-1657).