- FondsB - Fondo B (Archivo Nuevo)
- SubfondsC - Archivos Locales (Conventos y Casas)
- VER - Convento de San José de Vergara (Guipúzcoa)
- b - Legajos
- Series9 - Estudio y publicaciones. Biblioteca (1880-1957)
- File8 - Colegio; cuentas (1906-1940)
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- Item3 - Dictamen de D. Ramón María de Lili, Vicepresidente de la Diputación Provincial de Guipúzcoa, sobre falta de pago de dos alumnos al Colegio de Vergara, 29/12/1910
- Item4 - Carta del Director General de la Deuda y Clases pasivas a D. Miguel Villanueva, 06/03/1912
- Item5 - Carta de D. Miguel Villanueva a D.ª Dominica Goya, 08/03/1912
- Item6 - Comunicación por la Comisión Provincial de Guipúzcoa sobre el acuerdo de cobranza que grava los Establecimientos de Enseñanza, 15/06/1916
- Item7 - Respuesta de la Comisión Provincial de Guipúzcoa al Director del Real Seminario de Vergara, 15/06/1916
- Item8 - Bloqueo de la Cuenta Corriente del P. Rector del Real Seminario por el Banco de Bilbao, 05/11/1940