- FondsB - Fondo B (Archivo Nuevo)
- SubfondsC - Archivos Locales (Conventos y Casas)
- VER - Convento de San José de Vergara (Guipúzcoa)
- b - Legajos
- Series13 - Varios (1880-1988)
- File2 - Varia (1880-1988)
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- Item9 - Certificado de enfermedad y receta del Jefe facultativo del manicomio de Santa Águeda (1913)
- Item10 - Profesión de Fe y Juramento de Doctrina del P. Manuel María Sáinz, 17/06/1914
- Item11 - Correspondencia entre el Arcipreste de Vergara, el Obispado de Vitoria y la Sagrada Congregación de Sacramentos sobre permiso para oficiar misa (1925-1942)
- Item12 - Tarjetas de saludo, presentación y cartas (1929-1935)
- Item13 - Programa de los actos de los Cursos de Verano y V Congreso de Estudios Vascos sobre temas de Arte Popular que se celebrarán en Vergara en los días 31 de agosto a 8 de septiembre de 1930
- Item14 - Carta del Vicario General del Obispado de Vitoria al P. Prior de Vergara, 07/02/1933
- Item15 - Programa Oficial de la 1ª Asamblea Mariana Diocesana de Oñate del 30 de junio al 5 de julio de 1936
- Item16 - Esquela fúnebre del P. Eliseo Malzárraga y lista de las personas que han dado limosna para misas por él (1945)
- Item18 - Plano parte de la iglesia por D. Francisco de Vea-Murguía